Negli ultimi anni l’Ospedale Privato Accreditato si è dotato di un sistema informatico per la gestione amministrativa, la gestione informatizzata dei pazienti e, in parte, anche della cartella clinica: questo permette una velocizzazione delle procedure di fatturazione, di raccolta ed elaborazione dei dati per l'attuazione dei controlli qualitativi.

Nel 2006 Quisisana si è certificato in conformità alla norma UNI EN ISO 9001:2000 per i seguenti prodotti e servizi:
- progettazione ed erogazione di prestazioni di diagnosi e cura in regime di ricovero ordinario in medicina generale per pazienti acuti, lungodegenti post-acuzie e geriatrici,
- erogazione di prestazioni di diagnosi e cura in regime ambulatoriale per le specialità di cardiologia, endocrinologia, diagnostica per immagini,
- nel 2007 ha ottenuto l'estensione della certificazione per il servizio ambulatoriale di endoscopia digestiva,
- nel 2008 ha ottenuto l'estensione della certificazione per il servizio di "progettazione ed erogazione di diagnosi e cura in regime di ricovero per pazienti in stato vegetativo permanente",
- nel 2009 è stato eseguito il rinnovo della validità della certificazione in conformità alla norma UNI EN ISO 9001:2008,
- nel 2015 è stato eseguito il rinnovo della validità della certificazione in conformità alla norma UNI EN ISO 9001:2008.